Im Qualitätsmanagement ist das Unternehmen seit 1997 für die DIN EN ISO 9001 ständig im Prozess.
Honebein verfügt über die Schweißzertifikate DIN EN ISO 3834-3 (schweißtechnische Qualitätsanforderung) und DIN EN 15085 CL3 (Schweißen von Schienenfahrzeugen und -fahrzeugteilen).